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IGF2BP蛋白对m6A的识别增强了mRNA的稳定性和翻译

发布日期:2022-06-23 浏览次数:1714

背景介绍

大部分表观遗传研究都集中在与DNA以及DNA包裹的组蛋白相关的标记上。

1974年首次在mRNA中发现腺嘌呤上的一个甲基,这个被修饰的碱基被称作N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine),简写为m6A。m6A甲基化,拓宽了对表观转录组学(epitranscriptomics)的认识,通过测序数据分析,m6A修饰是在mRNA和非编码RNA(ncRNA)中是最丰富的一种。

在体内,m6A修饰主要被三类蛋白分子调节,催化在RNA上形成甲基化的酶一般称为“编码器”(writer,m6A甲基转移酶),去除在RNA上甲基化的酶被称为“消码器”(eraser,m6A去甲基化酶),识别RNA上甲基化的酶被称为“读码器”(reader,m6A结合蛋白或识别蛋白) 。因此,m6A甲基化修饰是个可逆的动态过程,分别由编码器写入和消码器消除,并且还可以通过读码器识别,参与并影响到一系列的生物学过程。

目前的研究常见的M6a组成分子


m6A影响的功能非常之广泛。在分子水平,m6A几乎影响到所有方面的mRNA的代谢,包括剪接、翻译、稳定性以及miRNA的成熟。这些被m6A调节的RNA代谢过程在这一系列的细胞进程中扮演着重要角色。在细胞水平,它可以影响免疫细胞的稳态、精细胞的发育、造血干细胞的造血功能、癌细胞的发生、神经细胞的发育等等。近些年来,据不完全统计,有关它的功能的报道已经有不下200篇高水平的文章。即使现今,它的火热程度也是有增无减,不断有高水平文章更新。

研究路线:

结果解读:

一、m6A结合蛋白的鉴定

二、敲低IGF2BPs对下游靶点的影响

三、IGF2BP2以m6A依赖的方式调控MYC的表达

四、 IGF2BPs作为m6A受体在癌症中发挥致癌作用

结论

经m6A修饰的mRNA优先被IGF2BP蛋白识别,从细胞核运输到细胞质产生三种效应:

1.在P-body(胞浆复合体,mRNA转录后调控过程中的一个重要场所)中降解;

2.输出到细胞质后的翻译;

3.在热休克等应激条件下,与IGF2BP结合的mRNA转运到应激颗粒中储存。

关键技术

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大部分表观遗传研究都集中在与DNA以及DNA包裹的组蛋白相关的标记上。

1974年首次在mRNA中发现腺嘌呤上的一个甲基,这个被修饰的碱基被称作N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine),简写为m6A。m6A甲基化,拓宽了对表观转录组学(epitranscriptomics)的认识,通过测序数据分析,m6A修饰是在mRNA和非编码RNA(ncRNA)中是最丰富的一种。

在体内,m6A修饰主要被三类蛋白分子调节,催化在RNA上形成甲基化的酶一般称为“编码器”(writer,m6A甲基转移酶),去除在RNA上甲基化的酶被称为“消码器”(eraser,m6A去甲基化酶),识别RNA上甲基化的酶被称为“读码器”(reader,m6A结合蛋白或识别蛋白) 。因此,m6A甲基化修饰是个可逆的动态过程,分别由编码器写入和消码器消除,并且还可以通过读码器识别,参与并影响到一系列的生物学过程。

目前的研究常见的M6a组成分子


m6A影响的功能非常之广泛。在分子水平,m6A几乎影响到所有方面的mRNA的代谢,包括剪接、翻译、稳定性以及miRNA的成熟。这些被m6A调节的RNA代谢过程在这一系列的细胞进程中扮演着重要角色。在细胞水平,它可以影响免疫细胞的稳态、精细胞的发育、造血干细胞的造血功能、癌细胞的发生、神经细胞的发育等等。近些年来,据不完全统计,有关它的功能的报道已经有不下200篇高水平的文章。即使现今,它的火热程度也是有增无减,不断有高水平文章更新。

研究路线:

结果解读:

一、m6A结合蛋白的鉴定

二、敲低IGF2BPs对下游靶点的影响

三、IGF2BP2以m6A依赖的方式调控MYC的表达

四、 IGF2BPs作为m6A受体在癌症中发挥致癌作用

结论

经m6A修饰的mRNA优先被IGF2BP蛋白识别,从细胞核运输到细胞质产生三种效应:

1.在P-body(胞浆复合体,mRNA转录后调控过程中的一个重要场所)中降解;

2.输出到细胞质后的翻译;

3.在热休克等应激条件下,与IGF2BP结合的mRNA转运到应激颗粒中储存。

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